MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	A	6	6	10	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008342	AT	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008342	TAA	2	6	61	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008342	ATA	2	6	102	107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008342	GGC	2	6	153	158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008342	ATG	2	6	176	181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008342	A	6	6	182	187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008342	ACT	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008342	CTGG	2	8	270	277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008342	CAAGCA	2	12	283	294	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008342	ATTT	2	8	3566	3573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008342	ATCA	2	8	3641	3648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008342	A	7	7	3672	3678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008342	CGAA	2	8	3721	3728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008342	A	6	6	4281	4286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008342	TGT	2	6	4302	4307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008342	ATT	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008342	TTC	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008342	CGC	2	6	4392	4397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008342	ACA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008342	T	6	6	4468	4473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008342	CTTC	2	8	7595	7602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008342	CTA	2	6	7623	7628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008342	CG	3	6	7667	7672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008342	GC	3	6	7675	7680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008342	ACAAA	2	10	7696	7705	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008342	CAG	2	6	7751	7756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008342	AGGC	2	8	7795	7802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008342	GCT	2	6	7803	7808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008342	AGCCA	2	10	7917	7926	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008342	CTGTC	2	10	8020	8029	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008342	ACA	2	6	8082	8087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008342	TTTTG	2	10	8365	8374	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008342	AAC	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008342	ATA	2	6	8490	8495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008342	CG	3	6	8540	8545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008342	GTGA	2	8	8576	8583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008342	TAAA	2	8	9329	9336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008342	CA	3	6	9352	9357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008342	TAA	2	6	9368	9373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008342	AT	3	6	9444	9449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008342	ACCG	2	8	9938	9945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008342	GAA	2	6	9956	9961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008342	A	7	7	9960	9966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008342	CTG	2	6	9992	9997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008342	T	7	7	10033	10039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008342	TG	3	6	10402	10407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008342	GGT	2	6	10431	10436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008342	TGG	2	6	10481	10486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008342	T	6	6	10543	10548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008342	TTTA	2	8	10647	10654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008342	AGC	2	6	11198	11203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008342	AGC	2	6	11209	11214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008342	AAG	2	6	11302	11307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008342	CGT	2	6	11391	11396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008342	CTGCG	2	10	11457	11466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008342	CCCG	2	8	11496	11503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_008342	A	6	6	12060	12065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008342	T	9	9	12085	12093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008342	CTG	2	6	12104	12109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008342	GCC	2	6	12204	12209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008342	CCAG	2	8	12293	12300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008342	GGC	2	6	12357	12362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008342	AAG	2	6	12366	12371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008342	AGG	2	6	12390	12395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008342	AAG	2	6	12453	12458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008342	G	6	6	12461	12466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008342	AAC	2	6	12488	12493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008342	AGA	2	6	12553	12558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008342	T	6	6	12621	12626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008342	TAAC	2	8	12646	12653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008342	TAT	2	6	13586	13591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008342	TACA	2	8	13604	13611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008342	CCCCG	2	10	13656	13665	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
75	NC_008342	A	6	6	13701	13706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008342	ATG	2	6	13793	13798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008342	T	6	6	13932	13937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008342	ATGT	2	8	13968	13975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008342	CCAAA	2	10	14020	14029	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008342	GTA	2	6	14067	14072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008342	C	7	7	14118	14124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_008342	AT	3	6	14138	14143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008342	CAGC	2	8	14187	14194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008342	ATT	2	6	14398	14403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008342	AAC	2	6	25349	25354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008342	TCA	2	6	25378	25383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008342	AGT	2	6	25988	25993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008342	TTG	2	6	26051	26056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008342	AGT	2	6	26064	26069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008342	AGA	2	6	26757	26762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008342	TGA	2	6	26776	26781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008342	TGT	2	6	26793	26798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008342	ATA	2	6	26818	26823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008342	GAC	2	6	27009	27014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008342	CT	3	6	27077	27082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008342	CAC	2	6	27137	27142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008342	AAGG	2	8	27150	27157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008342	GATCT	2	10	27961	27970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008342	AAG	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008342	TCAA	2	8	28646	28653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008342	TAA	2	6	28704	28709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008342	GA	3	6	28803	28808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008342	TCA	2	6	29916	29921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008342	TCG	2	6	29926	29931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008342	GGC	2	6	29993	29998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008342	TAAT	2	8	30026	30033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008342	AG	3	6	30096	30101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008342	ATA	2	6	30890	30895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008342	TAA	2	6	30921	30926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008342	AAAAGC	2	12	31317	31328	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008342	GCC	2	6	31399	31404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008342	ACG	2	6	31414	31419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008342	CTT	2	6	31452	31457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008342	GTCC	2	8	32865	32872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008342	GCCCG	2	10	32896	32905	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_008342	G	6	6	32957	32962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008342	CTTG	2	8	32970	32977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008342	TCCC	2	8	33036	33043	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_008342	GGC	2	6	33408	33413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008342	GGC	2	6	33523	33528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008342	GGT	2	6	33565	33570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008342	AGA	2	6	33600	33605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008342	GCC	2	6	33613	33618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008342	TAA	2	6	33638	33643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008342	AAT	2	6	33705	33710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008342	ATT	2	6	33752	33757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008342	TAA	2	6	33758	33763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008342	TAT	2	6	33774	33779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008342	ATC	2	6	33788	33793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008342	TTTA	2	8	33794	33801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008342	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008342	CAA	2	6	35604	35609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008342	GTC	2	6	35638	35643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008342	CAC	2	6	35696	35701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008342	TTG	2	6	35753	35758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008342	GTT	2	6	35840	35845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008342	ATC	2	6	35932	35937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008342	TCCA	2	8	35946	35953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008342	TAA	2	6	35989	35994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008342	TCC	2	6	35995	36000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008342	T	6	6	36088	36093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008342	TA	3	6	36214	36219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008342	TTTA	2	8	36261	36268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008342	ATA	2	6	36291	36296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008342	GGGC	2	8	36908	36915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008342	C	7	7	36920	36926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_008342	A	6	6	39160	39165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008342	ATT	2	6	39183	39188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008342	AT	3	6	39242	39247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008342	AT	3	6	39263	39268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008342	CATA	2	8	39278	39285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008342	TTCA	2	8	39286	39293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008342	T	7	7	39305	39311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_008342	GGC	2	6	39549	39554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_008342	AAG	2	6	39558	39563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008342	AGG	2	6	39582	39587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008342	AAG	2	6	39645	39650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008342	G	6	6	39653	39658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008342	GAA	2	6	40053	40058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008342	ATA	2	6	40161	40166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_008342	TTA	2	6	41394	41399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_008342	CGC	2	6	41436	41441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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168	NC_008342	AAT	2	6	47467	47472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_008342	GA	3	6	47558	47563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008342	CAG	2	6	47705	47710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_008342	A	6	6	53913	53918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_008342	GCAAG	2	10	53966	53975	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
184	NC_008342	T	7	7	55141	55147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_008342	T	6	6	55239	55244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008342	CATTT	2	10	55267	55276	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_008342	CGA	2	6	55401	55406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_008342	CAGC	2	8	55423	55430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
190	NC_008342	CCCG	2	8	55546	55553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
191	NC_008342	GTT	2	6	55559	55564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
192	NC_008342	TGG	2	6	55566	55571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.